《地下忍者》故事描述在日本,存在著世界上最龐大的暗殺組織。曾經盛極一時的日本忍者,因為戰後GHQ強迫解散組織後消失無蹤。不過事實上,忍者至今依舊暗中存在,人數據說多達20萬人。部分「精銳」忍者,在國家級的對抗中負責執行秘密任務有相當活躍情況。但下級忍者卻是經常拿不到工作,其中主角「雲隱九郎」也一樣,過著宛如尼特族般的生活……
製作委員會方面,今次動畫的導演將交給桑原智、角色設計為結城信輝、系列企劃以及劇本交給大知慶一郎、動畫製作的部分則是由手塚製作負責。目前《地下忍者》預定將自10月起於日本開播。